Es un órgano colegiado que coordina las acciones de seguimiento y evaluación del programa y promueve la institucionalización del enfoque de derechos humanos en el quehacer público.

El CSyE está compuesto por diez instituciones titulares (con sus suplencias), invitados permanentes y dos observadores, que tendrán reuniones periódicas en asamblea. Cada integrante titular tiene derecho a voz y a un voto, quedando de la siguiente manera:

Instancias públicas:

• Asamblea Legislativa del Distrito Federal (ALDF)

• Gobierno de la Ciudad de México (GCDMX)

• Tribunal Superior de Justicia de la Ciudad de México (TSJCDMX)

Instituciones académicas (con una suplencia rotativa) :

• Universidad Autónoma de la Ciudad de México (UACM)

• Universidad Autónoma de México (UAM)

Organizaciones de la Sociedad Civil

Titulares:

• Centro Vitoria

• Ednica I.A.P 

• Fundación Arcoiris

• Sin Fronteras I.A.P 

Suplentes:

• Centro de Orientación Alimentaria (COA Nutrición)

• Centro Operacional de la Vivienda y Poblamiento (COPEVI)

• Prodiana

• Transformarte 2. 0

La Oficina del Alto Comisionado para los Derechos Humanos (OACDH) y la Comisión de Derechos Humanos del Distrito Federal (CDHDF) fungen como observadores; así como las 16 delegaciones son invitadas permanentes, teniendo derecho a voz en las Asambleas.